Spectral photon-counting CT (sCT) appeared recently as a new imaging technique presenting fundamental advantages with respect to conventional CT and duel-energy CT. However, due to the reduced number of photons in each energy bin of sCT and various artifacts, image reconstruction becomes particularly difficult. This thesis focuses on the reconstruc...
Material decomposition is a fundamental and primordial problem in spectral photon-counting X-ray CT (sCT). The present thesis focuses on the development of material decomposition methods using spectral and morphological information embedded in multi-energy sCT images. In this framework, three methods were developed. For the first method, by using b...
The first two contributions of this thesis (Chapter 2 and 3) are models for unsupervised 2D alignment and learning 3D object surfaces, called Deforming Autoencoders (DAE) and Lifting Autoencoders (LAE). These models are capable of identifying canonical space in order to represent different object properties, for example, appearance in a canonical s...
Lattice Boltzmann Method (LBM) is a numerical tool for solving partial differential equation, LBM being a mesoscopic model dealing with the material containing a quantity of particles in order to simulate macroscopic phenomenon. As a numerical tool LBM has proved its capability to simulate complex fluid flow behaviours and more recently to process ...
Contrast Enhanced Spectral Mammography (CESM) and Contrast Enhanced Digital Breast Tomosynthesis (CEDBT) sont des techniques d'imagerie par rayons X à double énergie impliquant l'injection d'un agent de contraste vasculaire. Les deux techniques fournissent des informations sur l'hypervascularisation des lésions par l'absorption de contraste. CESM e...
L'imagerie médicale optique est limitée par la perte de résolution spatiale due à la diffusion des tissus biologiques. L'imagerie acousto-optique permet de palier à ce problème car elle utilise à la fois de lumière et des ondes ultrasonores. Par conséquent elle donne accès au contraste optique local en profondeur dans les tissus biologiques avec la...
L’analyse d’images médicales joue un rôle essentiel en cardiologie pour la réalisation du diagnostique cardiaque clinique et le suivi de l’état du patient. Parmi les modalités d’imagerie utilisées, l’imagerie par ultrasons, temps réelle, moins coûteuse et portable au chevet du patient, est de nos jours la plus courante. Malheureusement, l’étape néc...
Environ 15 millions d’enfants naissent prématurément chaque année dans le monde. Ces patients sont susceptibles de présenter des anomalies du développement cérébral qui peuvent causer des troubles du neuro-développement : paralysie cérébrale, surdité, cécité, retard du développement intellectuel, ... Le volume des structures cérébrales est un param...
L'imagerie médicale est un domaine vaste guidé par les avancées en instrumentation, en techniques d'acquisition et en traitement d’images. Les progrès réalisés dans ces grandes disciplines concourent tous à l'amélioration de la compréhension de phénomènes physiologiques comme pathologiques. En parallèle, l'accès à des bases de données d'imagerie pl...
The goal of this thesis is to design data-driven methods to identify subjects at risk to develop Alzheimer's disease. As it is a progressive disease, subtle signs can appear several years before the first clinical symptoms. Identifying subjects who show these signs, and who are likely to develop the disease in the coming years, is a crucial point t...
