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Les problèmes de classification de SARS-CoV-2

Authors
  • Parrochia, Daniel
Publication Date
May 27, 2021
Source
HAL-INRIA
Keywords
Language
French
License
Unknown
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Abstract

Deux types de méthodes permettent actuellement d’analyser la proxi- mité des vivants ou des virus : la classification automatique et les arbres phylogé- nétiques. La classification automatique permet d’évaluer la distances entre certaines séquences de génomes apparentés afin d’établir la proximité relative des éléments qui les portent. Les arbres phylogénétiques sont des représentations schématiques de l’évolution entre différentes espèces apparentées en fonction de leurs similitudes génétiques et physiques. Les virus sont des espèces biologiques qui comprennent des séquences d’acides nucléiques. Ils sont sujets à un large éventail de changements évolutifs, y compris des mutations de leurs séquences. La capacité de celles-ci à accu- muler des changements par mutations ou recombinaison avec d’autres espèces donne naissance à de nouvelles lignées virales. Les données dont on dispose aujourd’hui rendent complexes une attribution définitive de l’espèce SARS-Cov-2, à l’origine de la pandémie CoVid-19, et permettent difficilement de répondre à la question de son origine. Certaines particularités du virus laissent notamment planer un doute sur son origine naturelle.

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