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Molecular typing ofShigellastrains using pulsed field gel electrophoresis and genome hybridization with insertion sequences

Authors
Journal
Research in Microbiology
0923-2508
Publisher
Elsevier
Publication Date
Volume
142
Issue
5
Identifiers
DOI: 10.1016/0923-2508(91)90182-a
Keywords
  • Shigella
  • Genome
  • Molecular Typing
  • Pulsed Field Gel Electrophoresis
  • Insertion Sequences
  • Shigella
  • Genome
  • Typage Moléculaire
  • Electrophorèse En Champ Pulsé
  • Hybridation Avec Des Séquences D'Insertion
Disciplines
  • Medicine

Abstract

Résumé Le génome de 18 souches de Shigella isolées indépendamment (9 S. sonnei, S S. Dysenteriae et 4 S. flexneri) ainsi que celui de 4 souches de S. Flexneri isolées au cours d'une épidémie, a été analysé par électrophorèse en champ pulsé et par la distribution de séquences d'insertion (IS 1, IS 2, et IS 911). Malgré leur similítude génétique, les 9 souches isolées de S. sonnei ont pu être différenciées les unes des autres. Les 4 isolats indépendants de S. flexneri ont des profils d'AND clairement différents. Quant aux 4 souches de cette même espèce isolées au cours d'une épidémie, elles sont révélées pratiquement identiques par électrophorèse en champ pulsé ou par la distribution génomique des séquences d'insertion IS 1 et IS 2. Cependant, l'élément IS 911 s'est montré trop mobile pour être utilisé comme marqueur de ces souches. Les isolats de S. dysenteriae ont pu être aussi distingués à l'aide des deux méthodes utilisées. La diversité génetique mise en évidence chez cette dernière espèce s'est révélée particulièrement importante: sur les 5 isolats analysés, trois profils d'ADN complètement différents ont été mis en évidence. In conclusion, l'électrophorèse en champ pulsé ainsi que l'analyse de la distribution des séquences d'insertion ont démontré leur utilité potentielle pour le typage moléculaire des souches de Shigella. Le degré de différentiation offert par ces deux méthodes s'est révélé comparable, bien que la discrimination des souches analysées ait été meilleure par typage par les séquences d'insertion.

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