Les peptides sont devenus, au cours des années récentes, une alternative de plus en plus crédible aux petits composés chimiques. Une première partie de cette thèse porte sur l'optimisation de PEP-FOLD, une approche rapide et précise de prédiction de novo de la structure des peptides. Nous montrons qu'il est possible de biaiser la recherche conforma...
Comme les boucles protéiques sont très variables en termes de structure et de séquence elles sont souvent considérées comme des régions irrégulières. Au cours de ma thèse, j'ai développé une méthode statistique permettant d'analyser systématiquement des motifs structuraux récurrents extraits des boucles. Cette méthode utilise l'alphabet structural ...
Dans l'ère post-génomique, de nombreuses protéines identifiées par leur séquence demeurent de structure inconnue, non résolue expérimentalement, et non accessibles aux méthodes de modélisation comparative. L'objet de mon travail de thèse a été d'explorer une approche de prédiction de novo de la structure des protéines. Cette méthode est fondée sur ...
Les canaux mécanosensibles de large conductance (MscL) sont des protéines membranaires intégrales permettant à la bactérie de survivre lors de chocs hypo-osmotiques. Leur principale caractéristique est de s'ouvrir en réponse à un stress mécanique : une tension de la membrane. La compréhension de leur mode d'activation est un prérequis pour élabore...
L'évolution des technologies d'autofabrication assister par ordinateur permet la création de modèles physique pour des molécules biologiques complexes. La réalité augmentée, technologie d'interface d'ordinateur, permet le mélange d'objets réels et graphiques générés par ordinateur. Nous présentons une application qui démontre l'utilisation de modèl...
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Influence de l'encroutement superficiel du sol sur le fonctionnement hydrologique d'un versant sahélien (Niger) : expérimentations in-situ et modélisation THE8E Présentée par Christophe PEUGEOT Ingénieur de l'Ecole Nationale du Génie de l'Eau et de l'Environnement .de Strasbourg pour obtenir le titre de DOCTEUR de l'Université JOSEPH-FOURIER - GREN...
