Duchemin, Louis
Extent species and their genomes share a common history that stems from the ancestral ascent they share, and separated into distinct species through the accumulation of divergences between populations of the ancestral species. By gathering genomic sequences that originate from the same ancestral sequence, and analyzing their divergence, it is possi...
Morel, Marie
Les génomes des virus à ARN présentent des taux d'évolution parmi les plus élevés, ce qui leur permet de s'adapter rapidement en cas de changement d'environnement. Au sein de leurs hôtes, ces virus existent généralement sous la forme d'une population de mutants dont les génomes sont distincts, bien qu'apparentées. Cette caractéristique présente un ...
Phan, Thi Ngan
Meloidogyne graminicola (Mg), commonly known as the rice root-knot nematode, is a devastating pest worldwide, causing severe damages to rice production and other crops. The success of parasitism of this species in different rice-growing agrosystems raises questions about the origin, propagation, reproductive strategies and evolution of the genome i...
Parey, Elise
Les duplications complètes de génome sont des événements majeurs dans l’histoire évolutive des espèces. Elles produisent des copies surnuméraires de gènes qui peuvent acquérir de nouvelles fonctions et ainsi contribuer aux processus d’adaptation et de diversification. Deux duplications complètes de génome ont eu lieu dans la lignée précédant l’ancê...
Courcelle, Maxime
Depuis son émergence dans les années 1980, la génomique a révolutionné de nombreux domaines de l'étude du vivant. En fournissant de vastes jeux de données, elle a notamment donné la possibilité aux chercheurs de choisir les marqueurs moléculaires les plus adaptés pour répondre à leur question biologique. Au cours de mes travaux de thèse, j’ai étudi...
Duranton, Maud
La spéciation est un processus évolutif conduisant à la formation de nouvelles espèces grâce à l’établissement progressif de barrières d’isolement reproductif entre populations en cours de divergence. Comprendre de quoi sont constituées ces barrières, quelles sont les forces évolutives ayant permis leur mise en place et comment elles impactent la v...
Denise, Rémi
Les processus d'innovation moléculaire nécessitent le bricolage moléculaire et la cooptation des gènes existants. Mais ce processus reste mal compris sur de longues échelles évolutives. J’ai analysé durant cette thèse l'histoire évolutive d'un vaste groupe de systèmes moléculaires membranaires associés aux bactéries et aux archées - la superfamille...
Arnoux, Stéphanie
Domestication started thousand years ago when human shifted from hunter-gatherer to agrarian societies. They started selecting wild plants for phenotypes related to consumption andyield. This evolutionary process induced changes in the gene pool of domesticated plants. This thesis focuses on genetic footprints induced by domestication within a trio...
Herran, Benjamin
La différenciation sexuelle des Isopodes dépend d'une hormone sexuelle protéique, l'hormone androgène (HA), caractéristique des Malacostracés. Cet Insulin-Like Peptide suffit à induire par sa présence la différenciation mâle de ces Crustacés. Nous avons identifié in silico le transporteur circulant de l'HA, l'IGFBP-rP1, chez de nombreuses espèces d...
Altinli, Mine
Virus discovery has long depended on the observation of outbreaks, and the research to understand their pathogenicity depended on their culture. The advances of sequencing technology and molecular biology tech-niques allowed researchers to discover the ubiquity and the diversity of viruses. Despite these advances, virus discovery remains mainly foc...